多数手工雪茄和优质的烟叶产区都位于热带地区，这是一个易受飓风的地区。雪茄制造商以及烟农对于这些强大的风暴并不陌生，当它们即将来临时，会密切关注天气。其中一些风暴非常严重，甚至重塑了木咲美琴雪茄世界。
1998年的乔治斯飓风是第四类风暴，造成多米尼加国超过10亿美元的损失，有近400人死亡。那场风暴摧毁了富恩特酒庄的几个烟草仓库，这几个烟地正是为富恩特巨著系列种植茄衣。
由于没有烤炉来存放这些茄衣烟草，富恩特担心茄衣烟叶短缺，因此决定暂停巨著系列的生产。但是取而代之的是，小卡洛斯突发奇想，将茄衣换成康涅狄格阔叶烟叶，但是茄芯和茄套的烟叶不变，从而制成富恩特陈年系列。
古巴对飓风并不陌生，但是2008年是一个特别的季节，对其西部烟草种植地产生重大影响。当年古巴发生了三次打飓风，从8月30日发生的古斯塔夫开始，该飓风为四级风暴。古斯塔夫猛击皮纳德里奥省，淹没了农田，撕毁了3400多个烟草晾晒房，造成15000多处破损。
八天之后，艾克飓风以风暴的形式袭击，从东到西席卷古巴。它使得小岛湿透，对皮纳德里奥省的农田造成更大的。两个月后，第三场风暴帕洛玛飓风袭击东部。
总而言之，风暴造成数十亿的损失，了许多吨存储的烟草，其中大部分为茄芯烟叶，需要重建数千个晾晒房。“我们在飓风中生活了50年，但这是有史以来最糟糕的时期。”次年春天一个烟农总结说。
这场风暴是有记录以来袭击中美洲最致命的风暴之一，造成最大的是雨水，而不是风。这场五级风暴在其最高峰造成了11000多人死亡，其中大部分是在洪都拉斯和尼加拉瓜的雪茄生产国。这场风暴冲走烟草田的土壤，晾晒房，摧毁了中美洲一些基础设置，影响了雪茄生产。
牙买加曾经是一个雪茄工业强国，麦克纽杜雪茄曾经在这个国家生产，还有皇家牙买加雪茄品牌。这两个品牌都是使用本土种植的烟草制成的。1988年9月，吉尔伯特飓风以19英尺的风暴潮和每小时125英里的风速袭击牙买加，从东向西席卷了这个小岛，这一传统改变了。
它损坏了这个国家的雪茄工业。这场风暴摧毁了牙买加皇家金斯顿工厂，该工厂自1935年以来就一直存在，并在附近的五月湾了1000英亩的烟草。这是牙买加自1907年地震以来发生的最严重的的自然灾害，使得金斯顿变成了废墟。由于吉尔伯特的原因，牙买加烟草业倒退了几年。牙买加皇家雪茄的生产转移到多米尼加国，牙买加烟草不再用于生产麦克纽杜雪茄。
佛罗里达州基韦斯特曾经是美国雪茄生产的中心。1890年，全城共有130家工厂，每年手工生产一亿支雪茄。但是飓风影响西部雪茄贸易。该岛在1909年和1910年遭受了强烈的风暴袭击，1919年的主要基韦斯特飓风以四级风暴的形式席卷了该市。
韦斯特法尔博士在其著作《美国雪茄城基韦斯特》中写道，这只野兽“几乎摧毁或严重了镇上的每一家雪茄厂”。基韦斯特不在成为雪茄界的重要参与者。